所有獎項均以決賽分數為準。
獎牌
兩個年齡組別的獎項將會分開頒發。
- 金獎的分數下界為，在至少十二分之一決賽選手獲得金獎的前提下最高的分數。
- 銀獎的分數下界為，在至少四分之一決賽選手獲得金獎或銀獎的前提下最高的分數。
- 銅獎的分數下界為，在最多二分之一決賽選手獲獎的前提下最低的分數。
個人獎項
初級組決賽中三 / Grade 9 / Year 10 或以下的參賽者之中獲取最高分數者可獲頒「最佳年輕選手獎」。(2016年11月2日更新)
每個年齡組別中，首次報名參賽的最高分者可獲頒「最佳首次參賽選手」。
若上述條件出現相同分數，則所有同分者均可獲獎。
學校大獎
每一金、銀、銅獎牌得主可分別獲得 5、 2 及 1 分。每位得獎學生（香港電腦教育學會提名的學生除外）所屬學校將按此計算方法得出其學校總分，三間最高總分學校可獲「學校大獎」。
加入香港電腦奧林匹克競賽集訓隊
獲獎學生可獲邀請加入香港電腦奧林匹克競賽集訓隊，接受密集式訓練，備戰外地賽事。當中持香港永久性居民身分證者，更可參加四月/五月舉行的港隊遴選賽，屆時將遴選成員出戰 NOI 及 IOI，詳細的遴選規則將會於港隊遴選賽一個月前公佈。